对新型农村合作医疗基金专项审计中重点突出如下几方面：一是为有效地提高管理效益，增强合作医疗本身的抗风险能力，更好地保障农民的基本医疗，减少浪费，加强对新型农村合作医疗管理机构的审计监督；二是为维持合作医疗费用的收支平衡，减少不合理医疗开支，真正保障合作医疗参加者的基本医疗需要，加强对合作医疗卫生服务单位的审计监督；三是加强对新型农村合作医疗参加者的审计监督，主要是抽查是否存在多检查、多开药、滥..
