对于计算机病毒的存储结构来说，不同类型的病毒，在磁盘上的存储结构是不同的。

1.磁盘空间的总体划分经过格式化后的磁盘包括：主引导记录区（只有硬盘有）、引导记录区、文件分配表（FAT）、目录区和数据区。主引导记录区和引导记录区中存有DOS系统启动时所用的信息。

文件分配表（FAT）是反映当前磁盘扇区使用状况的表。每张DOS盘含有两个完全相同的FAT表，即FAT1和FAT2，FAT2是一张备份表。FAT与目录一起对磁盘数据区进行管理。目录区存放磁盘上现有的文件目录及其大孝存放时间等信息。数据区存储和文件名相对应的文件内容数据。

（1）软盘空间的总体划分当使用DOS的外部命令FORMAT格式化一张软盘后，不仅把磁盘划分为若干磁道，每一磁道划分为若干扇区，而且同时把划分的扇区分为五大区域，它们分别是引导记录区、文件分配表1、文件分配表2、根目录区以及数据区。

对于软盘只有一个引导区，引导区在磁盘的0面0道1扇区，它的作用是在系统启动时负责把系统两个隐含文件IO.SYS和MSDOS.SYS装入内存，并提供DOS进行磁盘读写所必需的磁盘I/O参数表。文件分配表（FAT表）是反映磁盘上所有文件各自占用的扇区的一个登记表，此表非常重要，一旦被破坏，将无法查找文件的内容。即使对DOS内部精通的人，要修复FAT表损坏的磁盘文件，亦非易事，开销很大。为此系统在划分磁盘区域时，保留了两份完全相同的文件分配表。根目录区是记载磁盘上所有文件的一张目录登记表。主要记载每个文件的文件名、扩展名、文件属性、文件长度、文件建立日期、建立时间以及其他一些重要信息。

（2）硬盘空间的总体划分对于不同类型、不同介质的磁盘，DOS划分磁盘的格式是不同的。对于硬盘来说，由于其存储空间比较大，为了允许多个操作系统分享硬盘空间，并希望能从磁盘启动系统，DOS在格式化硬盘时，把硬盘划分为主引导记录区和多个系统分区。

对于硬盘空间的分配由两个部分组成：第一部分就是整个硬盘的第一扇区，这一扇区称之为硬盘的主引导程序扇区，它由两部分内容组成，一是主引导程序，二是分区信息表。主引导程序是硬盘启动时首先执行的程序，由它装入执行活动分区（活动分区）引导程序，从而进一步引导系统。分区信息表登记各个分区引导指示符、操作系统指示符以及该分区占用硬盘空间的位置及其长度；第二部分是各个系统分区。各个系统分区是提供给各操作系统使用的区域，每一区域只能存放一种操作系统，在该区域中的系统具有自己的引导记录、文件分配表区、文件目录区以及数据区。若整个硬盘归DOS使用，硬盘上信息由5部分即第1扇区的主引导程序和分区信息表、分区引导程序、文件分配表区、文件根目录区、文件数据区。

硬盘主引导扇区很特殊，它不在DOS的管辖范围内。所以用DOS的非常驻命令FORMAT、FDISK、DEBUG都不能触及它。当该扇区损坏时，硬盘不能启动。用FORMAT、FDISK都不能修复它。DEBUG的L命令和W命令都不能用于主引导扇区。只有在DEBUG下借用INT13H或低级格式化方能修复。